Optimasi Isolasi DNA Genom Candida albicans dengan Metode Litium Karbonat

Fini Ainun Qolbi Wasdili, Aghes Silfia Putri, Sitti Romlah

Abstract


Abstrak

 

Candida albicans sebagai salah satu spesies jamur yang patogen, berperan terhadap 50% dari seluruh infeksi jamur akibat genus Candida. Isolasi DNA genom merupakan langkah awal dan sangat menentukan dalam studi genetika dan molekuler suatu spesies. Dinding sel Candida albicans terdiri dari dua lapis yang memungkinkan keberhasilan isolasi DNA genom rendah. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan optimasi isolasi DNA genom Candida albicans dengan metode litium karbonat. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah metode eksperimental dengan menggunakan variasi konsentrasi litium karbonat. Hasil isolasi metode litium karbonat tidak ditemukan pita pada hasil elektroforesis, sedangkan hasil kemurnian isolat kurang dari 1.8 sebanyak 9 sampel dan 3 sampel memiliki kemurniaan yang baik yaitu 1.8-2. Konsentrasi DNA terendah yaitu 0.95mg/ml dan tertinggi yaitu 57.5mg/ml. Simpulan, litium karbonat dengan metode optimasi yang digunakan tidak dapat mengisolasi DNA genom Candida albicans, namun bisa dicoba dengan litium klorida sebagai alternatif untuk isolasi DNA.

Kata Kunci : Litium karbonat, Optimasi, Isolasi, Candida albicans


Full Text:

PDF

References


Dayanti, F. G., Djuminar, A., Dermawan, A., & Tantan, A. (2012). Perbandingan Nilai Pengukuran Kuantitatif Hasil Ekstraksi DNA Salmonella typhi Menggunakan Metode Boiling, Naoh, Kit komersial. Jurnal Riset Kesehatan Poltekkes Depkes Bandung, 11(1), 350–357.

Ferniah, R. S., & Pujiyanto, S. (2013). Optimasi Isolasi DNA Cabai (Capsicum annuum L.) Berdasar Perbedaan Kualitas dan Kuantitas Daun serta Teknik Penggerusan. Bioma : Berkala Ilmiah Biologi, 15(1), 14. https://doi.org/10.14710/bioma.15.1.14-19

Fitriya, R. T., Ibrahim, M., & Lisdiana, L. (2015). Keefektifan Metode Isolasi DNA Kit dan CTAB/NaCl yang Dimodifikasi pada Staphylococcus aureus dan Shigella dysentriae. LenteraBio: Berkala Ilmiah Biologi, 4(1), 87–92.

Garcia-Rubio, R., de Oliveira, H. C., Rivera, J., & Trevijano-Contador, N. (2020). The Fungal Cell Wall: Candida, Cryptococcus, and Aspergillus Species. Frontiers in Microbiology, 10(January), 1–13. https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.02993

Hutami, R., Bisyri, H., Sukarno, S., Nuraini, H., & Ranasasmita, R. (2018). Ekstraksi DNA dari Daging Segar untuk Analisis dengan Metode Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP). Jurnal Agroindustri Halal, 4(2), 209–216. https://doi.org/10.30997/jah.v4i2.1409

Kornitzer, D. (2019). Regulation of Candida albicans hyphal morphogenesis by endogenous signals. Journal of Fungi, 5(1), 1–15.

Lõoke, M., Kristjuhan, K., & Kristjuhan, A. (2011). Extraction of genomic DNA from yeasts for PCR-based applications. BioTechniques, 50(5), 325–328. https://doi.org/10.2144/000113672

Ratnasari, Y. A., & Faridah, I. N. (2019). Otimasi Metode Isolasi Dna Sampel Fta Cards Menggunakan Purelink ® Genomic Dna Kits Dan Chelex-100 Optimization of Fta Cards Sample Dna Isolation Method Using Purelink ® Genomic Dna Kits and. Bachelor Thesis, 1. http://eprints.uad.ac.id/id/eprint/14764

Syafaruddin, S., & Santoso, T. J. (2020). Optimasi Teknik Isolasi dan Purifikasi DNA yang Efisien dan Efektif pada Kemiri Sunan (Reutalis trisperma (Blanco) Airy Shaw). Jurnal Penelitian Tanaman Industri, 17(1), 11. https://doi.org/10.21082/jlittri.v17n1.2011.11-17

Syahfitri, A., Staf, H., Program, P., & Agroekoteknologi, S. (2017). Uji Kualitas dan Kuantitas DNA Beberapa Populasi Pohon Kapur Sumatera. Animal Science and Agronomy Panca Budi, 2.

Yolanda, T., & Harun, M. (2020). Pra Rancangan Pabrik Pembuatan Litium Karbonat Kapasitas 44.000 ton/Tahun.




DOI: https://doi.org/10.37012/anakes.v8i2.1156

Refbacks

  • There are currently no refbacks.


Copyright (c) 2022 Fini Ainun Qolbi Wasdili, Aghes Silfia Putri, Sitti Romlah

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Address:
Universitas Mohammad Husni Thamrin
Jl. Raya Pd. Gede No.23-25, RT.2/RW.1, Dukuh, Kec. Kramat jati, Kota Jakarta Timur, Daerah Khusus Ibukota Jakarta 13550

Creative Commons License

Anakes : Jurnal Ilmiah Analis Kesehatan is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

View My Stats